政府组织创新要求加快服务型政府建设，必须坚持以人为本、执政为民，把维护人民群众的根本利益作为工作的出发点和落脚点；必须坚持与完善社会主义市场经济体制相适应，与建设社会主义民主政治和法治国家相协调，与国家现代化建设中长期战略相统一；必须坚持解放思想、实事求是、与时俱进，正确处理继承与创新、立足国情与借鉴国外经验的关系；必须坚持发挥中央和地方两个积极性，在中央的统一领导下，鼓励地方结合实际改革创新；必须坚持积极稳妥、循序渐进，做到长远目标与阶段性目标相结合，实现由量的积累向质的提升发展。
政府组织创新正确把握行政管理体制改革与全面改革的关系，坚持配套进行、整体推进行政管理体制改革与政治体制改革、经济体制改革、社会体制改革有着内在的联系，是政治体制改革的重要内容，也是全面改革的组成部分和关键环节。在新形势下，行政管理体制改革成为各项改革的交汇点和关结点，起到牵一发而动全身的作用；全面改革的推进，有赖于行政管理体制改革的深化和政府的转型。因此，深化行政管理体制改革既要加大力度，又不能孤立地进行，而必须从全局出发，与各项改革紧密结合起来。深化行政管理体制改革，为全面改革服务，说到底就是要扫除实现科学发展的体制性机制性障碍。当前，与经济体制改革相配套，就要加强政府经济调节和市场监管的职能，不断深化投资、财税、金融、价格、国有企业等领域的改革，健全宏观调控体系，努力促进经济结构调整和发展方式转变，更大程度地发挥市场在资源配置中的基础性作用。与政治体制改革相配套，就要进一步推进民主政治建设，以保证人民当家作主为根本，以增强党和国家活力、调动人民积极性为目标，扩大社会主义民主，全面落实依法治国方略，完善制约和监督机制，加强廉政建设，努力推进政府决策的科学化民主化。与社会体制改革相配套，就要强化政府社会管理和公共服务职能，特别要强化政府促进就业和调节收入分配职能，完善社会保障体系，健全基层社会管理体制；同时，要着力促进教育、卫生、文化等社会事业健康发展，建立健全公平公正、惠及全民、水平适度、可持续发展的公共服务体系，推进基本公共服务均等化。
