随着经济社会的不断发展，我国政府组织创新按照精简、统一、效能相结合和决策、执行、监督相协调的原则，正经历着新的蜕变。其目标主要有：
一是高度责任感的政府组织。在公共行政与公共管理领域，对于什么是责任始终存在着争论。但不可否认，责任在公共领域占据着十分重要的地位。责任政府既是现代民主政治的基本理念，又是一种对政府公共管理进行民主控制的制度安排。作为民主政治时代的一种基本价值理念，责任政府理念要求政府必须回应社会和民众的要求并加以满足，必须积极地履行其社会义务和职责。作为一种制度安排，责任政府意味着保证政府责任实现的责任控制机制，意味着强化对行政权力的监督和制约，如立法监督、司法监督和绩效评估监督等。
二是民主参与型的政府组织。政府是在公民本位、社会本位的理念指导下，在整个社会民主秩序的框架下，通过法定程序，按照公民意志组建起来的以为公民服务为宗旨并承担着服务责任的政府。实践证明，政府公职人员失去人民的有效监督，就可能独断专行，甚至腐化堕落。因此，建立结构合理，配置科学，程序严密，制约有效的政府绩效评估机制，加强对政府权力的监督，保证把人民赋予的权力真正用来为人民谋利益，是社会主义政治的基本要求。
三是专业化的政府组织。优质高效的政府必定是专业政府。专业政府意味着政府管理是一个日益专业化的行业，有着自身的内在规律，需要专门的知识和技能，因此从事政府管理的人员必须具备相应的专业素质。培育政府组织领导人的企业家精神，激发其成就需求，发挥其政治远见和管理经验优势，推动政府管理创新实践。管理创新是一种前人所未经历的开创性事业。
四是高绩效的政府组织。高绩效的政府，是一国经济和社会的可持续发展的基础。效率是判断一个公共管理体系是否优良的基本标准，同时也是判断政府是否有能力承担公共服务职能的主要标准。市场经济条件下，政府作为一种资源配置机制，通过提供公共物品、管理公共事务，消除或减少市场失灵、解决外部效应，提高资源配置效率，促进社会公平和经济的可持续发展。
